1.中華民國八十八年十一月十八日內政部（88）台孝授二字第11917號令訂定發布全文12條，並自發布日起施行
2.中華民國九十年六月十三日行政院（90）台處孝二字第05235號令修正發布名稱及全文17條（原名稱：原住民經濟事業發展基金收支保管及運用辦法）
3.中華民國九十一年四月十六日行政院（91）院授主孝二字第091002798號令修正發布第1、3～5條條文
4.中華民國九十三年一月十二日行政院原住民族委員會原民經字第0930001712號令修正發布第1、5、7～9條條文；並刪除第2條條文
5.中華民國九十六年十一月三十日行政院原住民族委員會原民經字第09600499521號令修正發布第1、4～7、9、10條條文
6.中華民國一百年七月十三日行政院原住民族委員會原民經字1001036032號令修正發布第4、5、11、15條條文
7.中華民國一百零八年二月二十五日行政院院授主基經字第 1080200140A號令修正發布 第1條、第3條至第5條條文
8.中華民國一百十年五月七日行政院院授主基經字第1100200522A號令修正發布第 5條、第6條、第9條條文